由姓来源主要有两支：其中较早的一支出自春秋时期晋国，相传是晋国外迁到秦国任宰相的“由余”的后代，姓氏即来源于他的名字。他的后人分为两大姓，一姓“由”，一姓“余”。另一支出自同时的楚国，由两位名人的名字而来：其一是出身于公族的王孙“由于”，另一位是楚国大夫“养由基”，他们的后代都有人以“由”为姓。